Научную работу организует проректор по научной работе кандидат педагогических наук, доцент Майбуров Андрей Генрихович. Основными направлениями научно-исследовательской работы преподавателей КГПИ в настоящее время являются следующие:

В аспирантуре КГПИ ведется подготовка по специальностям:

10.01.01 – «Русская литература» - филологические науки; 
13.00.01 – «Общая педагогика и история педагогики и образования» - педагогические науки;
24.00.01 - "Теория и история культуры" – культурология;
10.02.01 – «Русский язык» - филологические науки;
13.00.02 – «Теория и методика обучения и воспитания (иностранным языкам в общеобразовательной, средней профессиональной и высшей школе») – педагогические науки;
13.00.02 – «Теория и методика обучения и воспитания (технологии и предпринимательству в общеобразовательной, средней профессиональной и высшей школе») – педагогические науки.

В КГПИ функционируют 3 научно-исследовательские и 2 научно-методические лаборатории: 
1) научно-исследовательская лаборатория по специальной психологии и коррекционной педагогике;
2) научно-исследовательская лаборатория по психолого-педагогическому сопровождению этнокультурных процессов и социализации этносубъектов в Республике Коми;
3) научно-исследовательская лаборатория по региональной литературе и гендерным исследованиям;
4) научно-методическая лаборатория проблем профильного обучения;
5) научно-методическая лаборатория иностранных языков.

Преподаватели КГПИ являются членами 5 диссертационных советов. В Коми государственном пединституте функционирует методологический семинар соискателей ученой степени доктора педагогических наук. Его слушателями являются не только кандидаты наук КГПИ, но и ученые других вузов г. Сыктывкара. Организована работа научно-методологического семинара для аспирантов и соискателей ученой степени кандидата психологических наук. С 2003 г. профессор кафедры литературы Соколова Л.В. участвует в разработке и реализации Международного европейского проекта НИM 0417 Исследования по славянской филологии, финансируемой Министерством народного образования Испании и муниципалитетом Андалусии.

В 2007 году Коми пединститут проводит ряд научных мероприятий, среди которых наиболее значительными являются межрегиональная научно-практическая конференция «Модернизация педагогического образования и проблемы педагогики высшей школы: методология, практика, инновации», посвященная 75-летию КГПИ (февраль 2007г.), IV международная научная конференция «Национальный семиозис: дискурсы идентичности» (апрель 2007 г.), ежегодная научная конференция студентов, аспирантов, преподавателей КГПИ (март -июнь 2007 г.)., межрегиональная научно-техническая конференция «Техническое образование в школе и ВУЗе», приуроченная к 30- летию факультета технологии и предпринимательства (12-14 ноября 2007 г.).

19-20 апреля в рамках III Северного социально-экологического конгресса «Социальные перспективы и экологическая безопасность» в КГПИ пройдет работа секции «Профессиональная социализация личности и развитие кадрового потенциала региона», в которой примут участие руководители кадровых служб предприятий республики и специалисты кадровых агентств и служб занятости населения, преподаватели учреждений профессионального образования и специалисты системы дополнительного образования, научные работники. Исключительно важным направлением работы является организация научно-исследовательской работы студентов, которая включает в себя курсовые и дипломные работы, участие в научных студенческих конференциях. Различными формами НИРС в институте охвачено 91% студентов. В 2006 г. 10 человек награждены дипломами по итогам Открытого конкурса на лучшую работу студентов по естественным, техническим и гуманитарным наукам в ВУЗах Российской Федерации.